El parque abarca la parte central del macizo calizo de los Pienines con su punto culminante, el pico de las Tres Coronas (Trzy Korony, 982 m) y las pintorescas gargantas del río Dunajec. Estas cimas se distinguen por su variadas formas. Los pintorescos parajes abruptos y laderas sinuosas se elevan sobre el Dunajec hasta varios cientos de metros que los turistas pueden admirar durante su descenso en balsa. El rico manto vegetal presenta muchas especies endémicas y posglaciares, como el diente de león de los Pienines (terexacum pieninicum) y el erysimum pieninicum. Dominan los bosques de hayas y abetos blancos. Sobre las crestas descubiertas y terrazas rocosas crecen pequeños bosques primitivos de pinos. Enormemente rico es también el mundo animal, en éste el de los insectos, que acoge sobre todo a mariposas tan preciadas como el apolo o pavón diurno (parnassius apollo), la papillona Rey (papillon machaon) o la chupaleche (iphiclides podalirius). Reptiles y anfibios como el tritón, la salamandra común, la víbora común y otros están estrictamente protegidos. Los mamíferos están representados sobre todo por los roedores y 17 especies de murciélagos. Entre las aves destaca el treparriscos.
Este parque también se encuentra en la región de Malopolska y, dada su proximidad a Cracovia y a Zakopane, es muy popular entre los viajeros atrayendo a los visitantes para programar una estancia más diversa y divertida en la región.